Sejak awal pendirian SMP N 5 Petarukan, tahun 1999, Sekolah ini telah dipimpin oleh 14 Kepala Sekolah,yaitu :
R. Muh. Agus Sukarto, B.A.
Soedjarwo, S.H., M.K.
Karjudi, Bc. H.K.
Joko Sugiyanto, S.Pd., M.M.Pd.
Sarno, S.Pd.
Trini Winarti, S.Pd., M.Pd.
Drs. Soleh Riyadi, S.Pd., M.Pd.
Asrofi, S.Pd.
Mustadi, S.Pd., M.Pd.
Sobirin, S.Pd., M.Pd.
Sutarto, S.Pd.
Nasori, S.Pd.
Joko Priyono, S.Pd.
Koniah, S.Pd.
Pada tahun 2026, tepatnya tanggal 7 Mei 2026, sesuai dengan SK Bupati Pemalang, tentang Pengangkatan Kepala Sekolah di Lingkungan Pemerintah Kabupaten Pemalang, SMP Negeri 5 Petarukan, secara resmi dipimpin oleh seorang Kepala Sekolah yaitu Ibu Koniah, S.Pd. Sebelum mutasi ke SMP N 5 Petarukan, beliau sebelumnya menjabat sebagai Kepala Sekolah SMP Negeri 4 Bantarbolang. Berikut profil singkat beliau :
Nama : Koniah, S.Pd.
Tempat Tanggal Lahir : Pemalang, 11 September 1980
Alamat : Desa Sewaka, Kec. Pemalang, Kab. Pemalang, Jawa Tengah
Riwayat Pendidikan : -